Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD247P20963 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms