Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CREB1P16220 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CREB1P16220 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms