Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2AF1L5P0DN76 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2AF1L5P0DN76 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms