Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDKO14874 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms