Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DIRC3C9JPN6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms