Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPB1Q9UBR1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPB1Q9UBR1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms