Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDP1Q9P0J1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms