Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK13-1Q9NX77 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms