Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMILIN3Q9NT22 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms