Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms