Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms