Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP74Q9C0B2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP74Q9C0B2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms