Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms