Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EBF4Q9BQW3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EBF4Q9BQW3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms