Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ECSITQ9BQ95 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms