Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms