Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRBNQ96SW2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms