Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E2Q96LR5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E2Q96LR5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms