Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAF2Q96CS3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms