Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms