Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH3Q8IW03 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms