Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms