Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms