Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms