Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms