Protein–RNA interactions for Protein: Q4V348

ZNF658B, Zinc finger protein 658B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF658BQ4V348 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms