Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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