Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RBBP7Q16576 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP7Q16576 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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