Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIP10Q15642 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms