Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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