Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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AP3B2Q13367 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP3B2Q13367 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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