Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXO1Q12778 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXO1Q12778 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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