Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSRP1Q08945 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms