Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN1BQ07699 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN1BQ07699 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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