Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DEUP1Q05D60 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms