Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms