Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms