Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NHLH2Q02577 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NHLH2Q02577 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms