Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC10Q01780 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC10Q01780 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms