Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMF1P82094 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMF1P82094 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMF1P82094 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMF1P82094 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMF1P82094 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMF1P82094 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMF1P82094 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMF1P82094 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms