Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF3P61204 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms