Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH12P55289 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH12P55289 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH12P55289 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms