Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLTPP55058 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms