Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561P49447 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561P49447 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms