Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A3P48764 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms