Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms