Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA9P31269 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms