Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM21P19474 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms