Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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