Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBL4AP11441 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBL4AP11441 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBL4AP11441 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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